別府川（べっぷがわ）は、日本全国各地を流れる河川名称。 草谷川#別府川 - 兵庫県加古川市を流れる加古川水系草谷川・曇川分流の一級河川。 別府川 (佐賀県) - 佐賀県多久市を流れる六角川水系牛津川支流の一級河川。 新別府川 - 宮崎県宮崎市を流れる大淀川水系の一級河川。 別府川 (鹿児島県) - 鹿児島県姶良市を流れる本流の二級河川。
